蛋白质是由氨基酸链组成的,每个氨基酸的pH值都不同。蛋白质的总pH值是由单个氨基酸在溶解它们的特定溶液中形成离子时的pH值的混合物组成的。蛋白质的等电点(pI)是指蛋白质没有网的pH值电荷。利用这一特性,可以将具有已知pI的蛋白质与异质混合物中的其他蛋白质分离。
低于等电点的蛋白质带正电荷,高于该点的蛋白质带负电荷。氨基酸具有碱性的氨基端基,具有较高的pH值氨基酸的另一端是羧基末端,它是酸性的,pH值较低。在不同的pH值下,蛋白质上的氨基酸的电荷会发生变化。低于等电点的蛋白质带正电荷,而高于这一点的蛋白质则带负电荷蛋白质纯化,蛋白质的混合物受到电场的作用。这通常是在琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶中进行的,被称为等电聚焦。一种较老的技术是在玻璃柱中用两端带有电极的蔗糖溶液在更大范围内进行该过程。这种化合物被称为两性聚合物当凝胶或色谱柱受到电流的作用时,蛋白质会迁移到它们的等电点,然后保持静止。凝胶上的蛋白质通常通过结合蛋白质的染料可见。有时,如果正在研究酶,一种底物可用于产生有色反应。通常使用具有已知等电点蛋白质的标准品一旦人们知道了所需蛋白质的位置,一种常见的技术是从凝胶中分离出蛋白质,然后对蛋白质进行纯化和测序。一旦序列已知,它就可以用来设计聚合酶链反应(pcr)的引物,并在合适的核酸材料的情况下用于克隆蛋白质的基因等电聚焦也是分析密切相关的蛋白质的一种常用方法,以了解它们之间的差异。一个复杂的情况是蛋白质会有糖结合在它们身上。这被称为糖基化,并会影响蛋白质的pI。看起来可能有多个不同的蛋白质等电点,当实际上只有一种蛋白质被糖基化时,用标准方法如色谱法纯化的蛋白质,有时用等电聚焦法分析,以确保其纯度。

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