在遗传学领域,群体遗传学研究基因或等位基因的特定拷贝出现的频率,以及它们如何与来自其他基因的其他等位基因相互作用。它还研究进化过程,如自然选择和突变如何影响等位基因。等位基因的分布可以独立于其他等位基因当一个或多个等位基因的分布不独立于其他等位基因时,称为连锁不平衡。
如果一个人有一个棕色眼睛的等位基因和一个蓝色的等位基因,那么这个人的眼睛就会变成棕色。一个有机体的进化就发生了基因的不同组合,不同基因的等位基因的不同组合,导致有机体的不同表型。这意味着基因变异产生一个物种的有机体,它们相似,但看起来不同,功能也不同。遗传变异可以使一个有机体在生存和繁殖方面或多或少取得成功。自然选择理论认为进化是发生的通过优胜劣汰,或者更成功地将基因遗传给后代的人的生存。基因不是独立的单元,而是由它们自己遗传给后代,基因既受环境的影响,也受其他基因的影响。遗传共适应是指基因与其他基因相互作用的程度。自然选择倾向于那些在DNA中不同位置与其他基因的等位基因发生良好互动的等位基因。某些基因的等位基因之间可能存在遗传共适应例如,基因A和基因B各有两个等位基因,分别是A1和A2,B1和B2如果一个有机体遗传了A1和B1或A2和B2,在这个例子中可以假设它比继承A1和B2或A2和B1更适合生存。这意味着通过自然选择,A1B1和A2B2的遗传组合更容易存活和繁殖。因此,这些等位基因被称为连锁不平衡,因为它们不会被随机遗传给后代,而是有特定的配对。连锁不平衡是通过比较群体中等位基因的频率来衡量的,但这并不是永久性的,生物体间的随机交配会导致连锁等位基因的发生率降低,如果一个组合导致一个有机体的适应度更高,就会出现永久性连锁不平衡,例如当另一个组合导致合子中的致命突变时,等位基因的位置越远,就越难维持连锁不平衡。

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